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リファレンス

実験室リファレンス表

追跡可能なベンチ参考値: 物理定数、吸光係数、純度範囲、SI接頭語、濃度・希釈の表し方、一般的な換算。各表は出典とその根拠レベルを示しています。

出典の根拠レベル — T1: 国際規格と国家計量標準機関。T2: ピアレビュー文献と合意された方法規格。T3: 権威ある実験室マニュアルと教科書。T4: 二次的な集成と実務者向け資料。

物理定数

分子計算で使用される正確な値およびCODATA推奨値。

名称 値 単位・備考
アボガドロ定数 (Nₐ) 6.02214076 × 10²³ mol⁻¹ — SI定義により正確な値（2019年）。
素電荷 (e) 1.602176634 × 10⁻¹⁹ C — SI定義により正確な値。
ボルツマン定数 (k) 1.380649 × 10⁻²³ J·K⁻¹ — SI定義により正確な値。
気体定数 (R) 8.314462618 J·mol⁻¹·K⁻¹ — 導出値: R = Nₐ·k。
プランク定数 (h) 6.62607015 × 10⁻³⁴ J·s — SI定義により正確な値。
ファラデー定数 (F) 96485.33212 C·mol⁻¹ — 導出値: F = Nₐ·e.
原子質量定数 (u) 1.66053906892 × 10⁻²⁷ kg — CODATA 2022推奨値。
理想気体のモル体積 (Vₘ) 22.71095464 L·mol⁻¹ — 0 °C・100 kPaの理想気体; Vₘ = R·T / p。

出典:

  • CODATA 2022 (NIST) — CODATA Recommended Values of the Fundamental Physical Constants: 2022. National Institute of Standards and Technology, Gaithersburg, MD. レベル: T1
  • SI Brochure, 9th ed. (BIPM) — International System of Units (SI), 9th edition. Bureau International des Poids et Mesures, Sèvres — including the prefixes added by CGPM Resolution 3 (2022). レベル: T1

関連ツール: モル濃度計算ツール , 単位換算ツール

核酸・タンパク質の吸光係数

光路長1 cmにおける吸光度1単位（A₂₆₀/A₂₈₀）が表す濃度。

名称 値 単位・備考
二本鎖DNA 50 µg/mL per A260
一本鎖DNA 33 µg/mL per A260
RNA 40 µg/mL per A260
オリゴヌクレオチド（モルあたり） ≈ 10,000 × n M⁻¹·cm⁻¹ — 塩基数からの概算ε。精度が必要な場合はnearest-neighbor法を使用してください。
高純度タンパク質（標準的） 0.7–1.4 E(1 mg/mL) — Trp/Tyr/Cys含量により変動します — タンパク質自身の係数を使用してください。

出典:

  • Sambrook & Russell 2001 — Sambrook, J. & Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. レベル: T3

関連ツール: 核酸濃度計算ツール , タンパク質濃度計算ツール

A260/A280純度範囲

汚染のない核酸調製物の目安となる範囲。

名称 値 単位・備考
高純度dsDNA 1.8 許容範囲の目安 1.7–2.0。
高純度ssDNA 1.9 許容範囲の目安 1.8–2.0。
高純度RNA 2.0 許容範囲の目安 1.9–2.1。
タンパク質汚染 < 1.7 低い比率はタンパク質・フェノールの持ち込みを示唆します。

出典:

  • Sambrook & Russell 2001 — Sambrook, J. & Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. レベル: T3
  • Manchester 1997 — Manchester, K. L. (1997). When are nucleic acids not nucleic acids? Problems with estimation of nucleic acid purity by UV absorbance. Biochemical Education 25(4): 214–215. レベル: T2

関連ツール: 核酸濃度計算ツール , タンパク質濃度計算ツール

SI接頭語

実験で最もよく使われるメートル法接頭語。

名称 値 単位・備考
ギガ (G) 10⁹
メガ (M) 10⁶
キロ (k) 10³
ヘクト (h) 10²
デカ (da) 10¹
デシ (d) 10⁻¹
センチ (c) 10⁻²
ミリ (m) 10⁻³
マイクロ (µ) 10⁻⁶
ナノ (n) 10⁻⁹
ピコ (p) 10⁻¹²
フェムト (f) 10⁻¹⁵
アト (a) 10⁻¹⁸
2022年に追加 (Q, R, r, q) 10³⁰, 10²⁷, 10⁻²⁷, 10⁻³⁰ quetta、ronna、ronto、quecto — CGPM決議3（2022年）。

出典:

  • SI Brochure, 9th ed. (BIPM) — International System of Units (SI), 9th edition. Bureau International des Poids et Mesures, Sèvres — including the prefixes added by CGPM Resolution 3 (2022). レベル: T1

関連ツール: 単位換算ツール , モル濃度計算ツール

一般的な実験室換算

よく必要な等価関係。

名称 値 単位・備考
体積 1 mL = 1000 µL = 1 cm³
質量 1 g = 1000 mg = 10⁶ µg
水の質量 1 µL H₂O ≈ 1 mg (4 °C)
モル濃度 1 M = 1 mol/L = 1000 mM
モル濃度の下位単位 1 mM = 1000 µM; 1 µM = 1000 nM
温度 °C = (°F − 32) × 5/9
絶対零度 0 K = −273.15 °C
圧力 1 bar = 10⁵ Pa; 1 atm = 101 325 Pa

出典:

  • NIST SP 811 — Guide for the Use of the International System of Units (SI), NIST Special Publication 811, 2nd edition (A. Thompson & B. N. Taylor, 2008) — Appendix B: Conversion Factors. レベル: T1

関連ツール: 単位換算ツール , モル濃度計算ツール , 希釈計算ツール , PCRマスターミックス計算ツール , プレート正規化計算ツール , 細胞播種計算ツール , 血球計算盤 細胞数と生存率

濃度の表し方

実験で使う各濃度表現の定義。

名称 値 単位・備考
モル濃度 (c) 1 M = 1 mol·L⁻¹ 溶液1リットルあたりの溶質量。
質量/体積 (% (w/v)) 1 % (w/v) = 10 g·L⁻¹ 溶液100 mLあたりの溶質のグラム数。
体積/体積 (% (v/v)) 1 % (v/v) = 10 mL·L⁻¹ 溶液1リットルあたりの溶質のミリリットル数。
質量分率 (% (w/w)) 1 % (w/w) = 10 g·kg⁻¹ 溶液1キログラムあたりの溶質のグラム数。
希釈倍率 (DF) C₁V₁ = C₂V₂ 希釈工程において保存される物質量。

出典:

  • IUPAC Green Book, 3rd ed. — Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry, 3rd edition (E. R. Cohen, T. Cvitaš, J. G. Frey, B. Holmström, K. Kuchitsu, R. Marquardt, I. Mills, F. Pavese, M. Quack, J. Stohner, H. L. Strauss, M. Takami & A. J. Thor, eds.). Royal Society of Chemistry, 2007. レベル: T1

関連ツール: モル濃度計算ツール , 希釈計算ツール , タンパク質濃度計算ツール , 核酸濃度計算ツール , 細胞播種計算ツール , 血球計算盤 細胞数と生存率 , プレート正規化計算ツール

段階希釈の参考

試料をプレートに播種し、アッセイ系列を調製する際に用いる累積希釈。

名称 値 単位・備考
1回の1:10希釈 (10⁻¹) DF = 10 試料1体積を希釈液9体積に加える。
1:10希釈×2回 (10⁻²) DF = 100
1:10希釈×3回 (10⁻³) DF = 1000
1:10希釈×4回 (10⁻⁴) DF = 10 000
1:10希釈×5回 (10⁻⁵) DF = 100 000
1:10希釈×6回 (10⁻⁶) DF = 1 000 000
2倍希釈 (½) DF = 2 試料1体積を希釈液1体積に加える。
計数可能なプレート範囲 30–300 CFU/plate — 好気性菌のコロニー数えの慣例。

出典:

  • ISO 7218:2024 — ISO 7218:2024, Microbiology of the food chain — General requirements and guidance for microbiological examinations. International Organization for Standardization, Geneva, 2024. Supersedes the withdrawn ISO 7218:2007 and its Amendment 1:2013. レベル: T1
  • FDA BAM Chapter 3 — U.S. Food and Drug Administration. Bacteriological Analytical Manual (BAM), Chapter 3: Aerobic Plate Count. レベル: T3
  • CLSI M07 — Clinical and Laboratory Standards Institute. Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically, 12th edition (M07), 2024. レベル: T2
  • 計数可能なプレート範囲: FDA BAM Chapter 3 — U.S. Food and Drug Administration. Bacteriological Analytical Manual (BAM), Chapter 3: Aerobic Plate Count. レベル: T3

関連ツール: 段階希釈計算ツール , 希釈計算ツール , CFU/mL計算ツール , PCRマスターミックス計算ツール

正規分布の分位数の参考

有意性と検出力に用いる標準正規分布の値。

名称 値 単位・備考
両側95 %限界 (z(0.975)) 1.959964 標準正規分布の中央95 %を限界とする。
片側5 %限界 (z(0.95)) 1.644854 片側検定における上側臨界値。
検出力80 % (z(0.80)) 0.841621 標準正規分布の80パーセンタイル。
検出力90 % (z(0.90)) 1.281552 標準正規分布の90パーセンタイル。

出典:

  • Fleiss 2003 — Fleiss, J. L., Levin, B. & Paik, M. C. (2003). Statistical Methods for Rates and Proportions, 3rd edition. Wiley — sample-size estimation for comparing two means. レベル: T3
  • Acklam — Acklam, P. J. An algorithm for computing the inverse normal distribution function. Statistics Division, University of Oslo — rational approximation used for the normal quantiles in this site’s calculators. レベル: T4

関連ツール: サンプルサイズ計算ツール

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