이 사이트가 무엇인가
13종의 공개 계산기가 9개 범주로 나뉘어 있습니다. 희석과 농도, 분자생물학, DNA와 RNA, 단백질, 세포 배양, 단위 변환, 실험실 실무, 실험 계획, 참고 데이터입니다. 이와 함께 개별 계산이 아닌 3개의 작업 공간이 있습니다. 96웰 플레이트 플래너, 시약 재고 대장, 그리고 각 값이 출처를 밝히는 참고표 모음입니다.
모든 것이 무료이고, 로그인 뒤에 잠긴 것은 없으며, 미리보기나 자리표시자로 표시된 도구는 없습니다. 본 사이트는 귀하의 브라우저로 전달되는 페이지들의 집합이며, 귀하를 모델로 만드는 서버 쪽 처리는 없습니다.
왜 존재하는가
이 계산의 대부분은 잘 알려져 있습니다. 1년 동안 연속 희석을 해 온 기술자에게 C₁V₁ = C₂V₂가 무엇을 말하는지 알려 줄 필요는 없습니다. 지치는 것도, 오후 4시에 시험관을 손에 들고 있을 때 잘못되는 것도, 그때그때 다시 유도해 내는 일입니다. 뒤집었어야 할 계수, 소리 없이 바뀐 단위, 종이 위에서는 문제없던 용량이 웰 안에서는 불가능해지는 일입니다.
BiomeBench는 그 층위를 지루하게 만들기 위해 존재합니다. 실험에 대한 판단을 대체하려는 것이 아니라, 그 아래에 놓인 작은 계산상 불확실성을 없애려는 것입니다.
방법은 숨기지 않고 표면 위에
각 계산기는 결과가 표시되는 같은 페이지에서, 자신이 적용하는 관계식과 그것이 의존하는 가정과 자신의 유효 범위를 밝힙니다. 모든 도구에 이를 위한 패널이 있습니다. 수식이 어디에서 가져온 것인지 문헌은 흘려듣지 않고 인용하며, 단위는 가정하지 않고 표시합니다. 단위가 보이지 않는 수는 아무도 확인할 수 없는 수이기 때문입니다.
이는 설계 관점이지 예의가 아닙니다. 도구가 자신의 방법을 보여주지 않으면 귀하에게 신뢰를 요구하게 되고, 벤치에서 신뢰는 잘못된 도구입니다.
계산이 어떻게 확인되는가
평범한 단위 테스트 외에도 본 프로젝트는 2개의 검증 스위트를 유지합니다. 이 스위트는 계산기 출력과 플레이트 배분을 첫 원리에서 다시 계산합니다. 같은 전사 오류가 스스로를 잡아낼 수는 없으므로 의도적으로 다른 수치 경로를 택하고, 명시한 허용 오차 안에서 둘을 비교합니다. 이 스위트는 자체 출처 감사에 따라, 검증 대상인 코드를 가져오는 것이 금지되어 있습니다.
그것이 무엇을 입증하고 무엇을 입증하지 못하는지 분명히 적어 둡니다. 입증되는 것은, 문서화된 모델에 대한 두 독립된 구현이 허용 오차 안에서 일치한다는 사실입니다. 귀하의 검정에 그 모델이 맞다는 사실은 입증되지 않으며, 이것은 프로젝트 밖 누군가가 한 검증이 아닙니다.
귀하의 작업은 귀하의 기기에만 남습니다
입력값은 브라우저에서 처리되며 어디로도 전송되지 않습니다. 귀하가 저장하기로 한 작업 — 레이아웃, 재고 항목, 수집한 결과 — 은 biomebench- 로 시작하는 키로 귀하 브라우저의 로컬 저장소에 기록되며, 거기서 삭제할 수 있습니다. 본 사이트는 쿠키를 설정하지 않고 분석이나 광고 스크립트를 불러오지 않습니다.
이는 약속이라기보다 구조에서 나오는 결과입니다. 계정도 데이터베이스도 없으므로 실험 데이터가 쌓일 장소가 없습니다.
BiomeBench가 주장하지 않는 것
실험실 정보 관리 시스템이 아니며, 기계를 보관하거나 시약을 주문하거나 공식 기록 시스템이 되지는 않습니다. 임상·진단·치료 지침을 제공하지 않습니다. 구독으로 수익을 내지 않으며, 시설이 이미 쓰고 있을 수 있는 대형 상용 스위트 도구와 경쟁 구도를 만들지 않습니다.
인증도 공인도 추천도 아무것도 게시하지 않으며, 이 사이트 뒤에 법인이 존재한다고 주장하지도 않습니다. 본 프로젝트가 자기 코드로 답할 수 없는 부분이 있으면, 이 페이지들은 추측하는 대신 그렇게 적습니다.
벤치에서의 하루에 어디에 놓이는가
계산은 하나의 질문에 답합니다. 결과는 귀하가 작업 중인 실험에 담아 두고 다른 곳에서 입력으로 다시 쓸 수 있습니다. 이미 풀어 낸 희석을 플레이트 레이아웃에 다시 입력할 필요가 없습니다. 플래너는 그것을 웰로 바꾸고, 레이아웃의 용적과 공간적 일관성을 확인하고, 이식 가능한 기록으로 내보냅니다. 재고 기능은 그 시약이 아직 남아 있는지 다음 날 아침의 질문에 답합니다.
오늘날 플레이트 작업은 96웰입니다. 행은 A부터 H까지, 열은 1부터 12까지입니다. 다른 플레이트 형상은 대충 지원되기보다는 지원되지 않습니다.